Fondi për të Drejtën Humanitare posedon bibliotekën e specializuar, të dedikuar mbledhjes dhe ruajtjes materialeve në lidhje me fushën e drejtësisë transicionale, ballafaqimi më të kaluarën , e drejta humanitare, si dhe historisë, sociologjisë dhe fusha tjera të ngjashme. Koleksioni i saj përmban memoaret, eseje. raporte të organizatave të ndryshme, transkripte nga konferenca, deklarata, filma dokumentar etj. Biblioteka ju mundëson të punësuarve në FDH, hulumtuesve, studentëve që të gjejnë literaturën e duhur dhe informacionet në lidhje me publikime nga fushat e përmendura.
Biblioteka në koleksionin e saj posedon 5196 tituj (5432 kopje fizike.)Sipas llojit të publikimeve biblioteka përmban: 4006 monografi (4235 ekzemplar), 981 ekzemplar të publikimeve serial dhe revistave , 33 tituj në 40 ekzemplar në CD dhe DVD publikime dhe 176 ekzamplar.
Biblioteka është inkuadruar në bazën e të dhënave elektronike bibliografike COBISS dhe koleksioni i saj mund të gjendet në internet :
Biblioteka merret me përpunimin e biografive të librave të cilat i shërbejnë hulumtuesve të FDH për të ofruar pasqyrën e literaturës mbi tema të caktuara (cilat janë të vendosura në bibliotekën e FDH). Deri tani janë kryer tri bibliografi të cilat regjistrojnë publikimet me çështjet Kosova, Bosnja dhe Hercegovina, dhe Kroacia, me fokus të veçantë në krimet të luftës dhe shkeljet e të drejtave të njeriut gjatë konfliktit. Përveç këtyre temave , aty gjinden dhe vepra teorike letrare autorëve nga këto regjione.